Rada rovněž zásadně okleštila Habartovy pravomoce, když rozhodla, že všechny dokumenty musí spolupodepsat i Navrátil. Novinkou je také nařízení, že všechny zakázky nad 200 milionů korun musejí projít správní radou.
Pro Habartův osud v čele organizace, která vládne stamiliardovým majetkem a ročně do tratí investuje desítky miliard, je zásadní i další rozhodnutí vrcholného orgánu. Podle něj musí být nejpozději během března vypsáno řádné výběrové řízení na generálního ředitele SŽDC. Habarta totiž vládne státní organizaci jen jako pověřený šéf a nikoliv jmenovaný generální ředitel. Chybí mu totiž potřebná kvalifikace a praxe na dráze, konkurzem tak zřejmě neprojde. To by se naopak mohlo povést Navrátilovi, který již post náměstka zastával a dodnes je díky své odbornosti zapsán v obchodním rejstříku jako statutární orgán.
Habartu do SŽDC přivedl v roce 2010 tehdejší ministr dopravy Vít Bárta. Konec železničního šéfa tak může souviset i s emancipací nového ministra Pavla Dobeše, který se podle některých zpráv z resortu snaží vymanit z Bártova vlivu. Habarta se ale dostal v poslední době i do věcných sporů s ministerstvem, kterému se nelíbil způsob zadávání některých zakázek. Jeden případ skončil u antimonopolního úřadu. SŽDC naopak nepřímo poukazovala na to, že ministerstvo zakázky administrativně brzdí a může tak způsobit ztrátu evropských peněz.
To vše se děje v době, kdy má být každým dnem vypsána takzvaná zakázka desetiletí, kterou je výstavba koridoru mezi Rokycany a Plzní za zhruba osm miliard korun. SŽDC se také v posledních měsících stala terčem kritiky dopravců za to, že prudce zvedla ceny za užití kolejí, ačkoliv se za loňský rok chlubí dvoumiliardovým ziskem. Část dopravců dokonce podala stížnost k Drážnímu úřadu.
Habarta v minulosti působil například ve společnosti ČD Telematika nebo v týmu organizátorů libereckého mistrovství světa v lyžování. Správní rada se dnes také seznámila s plánem správy železnic postupně přejít pod značku Česká železnice. Radní plán nezavrhli, takže příprava proměny pokračuje dál.
